Auch ihr Erhaltungszustand, ihre Seltenheit und die gewaltigen Lücken zwischen den Vorkommen oder zu den Nächstverwandten sind Thema der  Paläontologie. Das Stadtgebiet Wiesbadens ist ein Beispiel hierfür. Vom Rhein bis zu den ersten Taunuskämmen erstreckt sich eine von Sanden, Kiesen und Löß gefüllte Senke, die noch immer mit dem Oberrheingraben absackt. In den Kiesen und Sanden finden sich Fossilien aus der jüngsten Vergangenheit, dem Zeitalter des Klimawandels oder Quartärs. Darunter fehlen die Sedimente einiger Millionen Jahre, die von Wind und Wasser beseitigt wurden. In den Wiesbadener Steinbrüchen lassen sich dann Kalke aus Meeresablagerungen aus einer Zeit vor etwa 20 bis 30 Millionen Jahren entdecken. Und schließlich zeugen die Schiefer des Taunus von einem Ozean vor etwa 380 Millionen Jahren.

Besonders spannend in der Wiesbadener Ausstellung ist die wechselvolle Geschichte des Mainzer Beckens im Tertiär. Breits im 19. Jahrhundert begannen die Brüder Sandberger diese Lebenswelt zu erforschen und die Fossilien wurden weltbekannt. Vor 31 Millionen Jahren war das Gebiet von einem subtropischen Meer bedeckt, das im Süden bei Basel endete. An der Küste bildeten sich zeitgleich Kiese und Sande, die zur Alzey-Formation gehören und unzählige Fossilien enthalten. Zahlreiche ökologische Nischen sind durch entsprechende Meerestiere belegt. Das Meer war warm, bis zu 180 Meter tief und von Riesenhaien und ihrer Nahrung, wie beispielsweise Thunfischen oder Seekühen, bevölkert. Letzteren stand an den flachen Sand- und Kiesküsten Seegras zur Verfügung. Im Laufe der Jahrmillionen verflachte das Meer zunehmend und die Verbindung zum Nordmeer wurde unterbrochen. Zwischen Oberrheingraben und Mainzer Becken bildeten sich vor 24 Millionen Jahren eine Barriere aus Algenriffen und eine flache Lagune. Der entstandene Kalkstein diente bis in die neuste Zeit als Grundlage für die Zementproduktion in der Region. Die zunehmend brackigen Lebensbedingungen förderten das Wachstum einiger Muscheln und Schnecken, die mit wenigen Arten in solchen Massen auftraten, dass sie millionenfach die sogenannten Hydrobienschichten bildeten.